內存溢出問題是參加kaggle比賽或者做大數據量實驗的第一個攔路虎。
以前做的練手小項目導致新手產生一個慣性思維――讀取訓練集圖片的時候把所有圖讀到內存中,然後分批訓練。
其實這是有問題的,很容易導致OOM。現在內存一般16G,而訓練集圖片通常是上萬張,而且RGB圖,還很大,VGG16的圖片一般是224x224x3,上萬張圖片,16G內存根本不夠用。這時候又會想起――設置batch,但是那個batch的輸入參數卻又是圖片,它只是把傳進去的圖片分批送到顯卡,而我OOM的地方恰是那個“傳進去”的圖片,怎麼辦?
解決思路其實說來也簡單,打破思維定式就好了,不是把所有圖片讀到內存中,而是隻把所有圖片的路徑一次性讀到內存中。
大致的解決思路為:
將上萬張圖片的路徑一次性讀到內存中,自己實現一個分批讀取函數,在該函數中根據自己的內存情況設置讀取圖片,只把這一批圖片讀入內存中,然後交給模型,模型再對這一批圖片進行分批訓練,因為內存一般大於等於顯存,所以內存的批次大小和顯存的批次大小通常不相同。
下面代碼分別介紹Tensorflow和Keras分批將數據讀到內存中的關鍵函數。Tensorflow對初學者不太友好,所以我個人現階段更習慣用它的高層API Keras來做相關項目,下面的TF實現是之前不會用Keras分批讀時候參考的一些列資料,在模型訓練上仍使用Keras,只有分批讀取用了TF的API。
Tensorlow
在input.py裡寫get_batch函數。
def get_batch(X_train, y_train, img_w, img_h, color_type, batch_size, capacity): ''' Args: X_train: train img path list y_train: train labels list img_w: image width img_h: image height batch_size: batch size capacity: the maximum elements in queue Returns: X_train_batch: 4D tensor [batch_size, width, height, chanel], dtype=tf.float32 y_train_batch: 1D tensor [batch_size], dtype=int32 ''' X_train = tf.cast(X_train, tf.string) y_train = tf.cast(y_train, tf.int32) # make an input queue input_queue = tf.train.slice_input_producer([X_train, y_train]) y_train = input_queue[1] X_train_contents = tf.read_file(input_queue[0]) X_train = tf.image.decode_jpeg(X_train_contents, channels=color_type) X_train = tf.image.resize_images(X_train, [img_h, img_w], tf.image.ResizeMethod.NEAREST_NEIGHBOR) X_train_batch, y_train_batch = tf.train.batch([X_train, y_train], batch_size=batch_size, num_threads=64, capacity=capacity) y_train_batch = tf.one_hot(y_train_batch, 10) return X_train_batch, y_train_batch
在train.py文件中訓練(下面不是純TF代碼,model.fit是Keras的擬合,用純TF的替換就好了)。
X_train_batch, y_train_batch = inp.get_batch(X_train, y_train, img_w, img_h, color_type, train_batch_size, capacity) X_valid_batch, y_valid_batch = inp.get_batch(X_valid, y_valid, img_w, img_h, color_type, valid_batch_size, capacity) with tf.Session() as sess: coord = tf.train.Coordinator() threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord) try: for step in np.arange(max_step): if coord.should_stop() : break X_train, y_train = sess.run([X_train_batch, y_train_batch]) X_valid, y_valid = sess.run([X_valid_batch, y_valid_batch]) ckpt_path = 'log/weights-{val_loss:.4f}.hdf5' ckpt = tf.keras.callbacks.ModelCheckpoint(ckpt_path, monitor='val_loss', verbose=1, save_best_only=True, mode='min') model.fit(X_train, y_train, batch_size=64, epochs=50, verbose=1, validation_data=(X_valid, y_valid), callbacks=[ckpt]) del X_train, y_train, X_valid, y_valid except tf.errors.OutOfRangeError: print('done!') finally: coord.request_stop() coord.join(threads) sess.close()
Keras
keras文檔中對fit、predict、evaluate這些函數都有一個generator,這個generator就是解決分批問題的。
關鍵函數:fit_generator
# 讀取圖片函數 def get_im_cv2(paths, img_rows, img_cols, color_type=1, normalize=True): ''' 參數: paths:要讀取的圖片路徑列表 img_rows:圖片行 img_cols:圖片列 color_type:圖片顏色通道 返回: imgs: 圖片數組 ''' # Load as grayscale imgs = [] for path in paths: if color_type == 1: img = cv2.imread(path, 0) elif color_type == 3: img = cv2.imread(path) # Reduce size resized = cv2.resize(img, (img_cols, img_rows)) if normalize: resized = resized.astype('float32') resized /= 127.5 resized -= 1. imgs.append(resized) return np.array(imgs).reshape(len(paths), img_rows, img_cols, color_type)
獲取批次函數,其實就是一個generator
def get_train_batch(X_train, y_train, batch_size, img_w, img_h, color_type, is_argumentation): ''' 參數: X_train:所有圖片路徑列表 y_train: 所有圖片對應的標籤列表 batch_size:批次 img_w:圖片寬 img_h:圖片高 color_type:圖片類型 is_argumentation:是否需要數據增強 返回: 一個generator,x: 獲取的批次圖片 y: 獲取的圖片對應的標籤 ''' while 1: for i in range(0, len(X_train), batch_size): x = get_im_cv2(X_train[i:i+batch_size], img_w, img_h, color_type) y = y_train[i:i+batch_size] if is_argumentation: # 數據增強 x, y = img_augmentation(x, y) # 最重要的就是這個yield,它代表返回,返回以後循環還是會繼續,然後再返回。就比如有一個機器一直在作累加運算,但是會把每次累加中間結果告訴你一樣,直到把所有數加完 yield({'input': x}, {'output': y})
訓練函數
result = model.fit_generator(generator=get_train_batch(X_train, y_train, train_batch_size, img_w, img_h, color_type, True), steps_per_epoch=1351, epochs=50, verbose=1, validation_data=get_train_batch(X_valid, y_valid, valid_batch_size,img_w, img_h, color_type, False), validation_steps=52, callbacks=[ckpt, early_stop], max_queue_size=capacity, workers=1)
就是這麼簡單。但是當初從0到1的過程很難熬,每天都沒有進展,沒有頭緒,急躁佔據了思維的大部,熬過了這個階段,就會一切順利,不是運氣,而是踩過的從0到1的每個腳印累積的靈感的爆發,從0到1的腳印越多,後面的路越順利。
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